Oversigt:Efter en periode med fred står vores fire ninjahelte over for en ny farlig fjende. Lloyd Garmadon – søn af deres ærkefjende Lord Garmadon – har sluppet fire ældgamle ondskabsfulde slangeracer med magiske våben og enestående kræfter løs. Et forladt skib bliver det nye ninjahovedkvarter, og den opfindsomme Jay forvandler det til et flyvende fort. Ninjavåbnene viser sig at indeholde flere kræfter end man kan se med det blotte øje, og sensei Wu lærer ninjaerne at forvandle deres våben til stærke fartøjer, som kan hjælpe dem i kampen mod slangerne. Der opstår splittelse blandt ninjaerne, da de hører om en ældgammel legende: Én ninja vil blive større end alle andre ninjaer og forvandles til Den Grønne Ninja, som skal kæmpe den ultimative kamp... men hvem?